在現實生活中，主角阿浩名叫沈浩，是個17歲的高中青年，從是個神奇寶貝迷，口袋妖怪遊戲更是不知玩了多少遍，充滿正義感，愛打抱不平，所以從跟叔叔學習空手道，父母常年在外，每個月定期打錢他，14歲那年叔叔被美國聘請為空手道教練，又只又他一個人。這天在下大雨，他代表市裡參加全省的空手道大賽，決賽時因為裁判不公，他屈居亞軍，見市裡多次交涉無效，他毅然解下腰帶，大步跑出比賽中心，跑了很遠，突然一聲巨響，沒錯，他被打中了，奇蹟的是他沒死，但全身漆黑，還沒等他反應過來，又連著幾下，他終於暈了過去......

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“人類，醒醒，醒醒。”他慢慢睜開眼睛，“你是你是你是未知圖騰。”沒錯在他面前的正是未知圖騰，一個人形的未知圖騰。“我為什麼會在這裡呀。”它很驚訝居然有人認識它。它：“事情是這樣的，我剛才在練習打雷絕招，沒想到威力太大，打穿了我這個空間，打中了你，你居然沒死，我不服氣，便又打了幾下，你終於暈過去了......”沒等它完，阿浩就，“你有沒有人性呀？一下不夠，你還打幾下？”“我又不是故意的，再了誰讓你像強一樣，打不死。算了，對不起，我錯了。對了，我叫未未，你叫什麼？”阿浩頓時要吐了。

想了想“沈”這個姓在神奇寶貝那個世界並不好，突然靈光一閃，“我叫聖光浩，你可以叫我阿浩。不過，既然你打害了我，那你就要賠償我。”“你要我怎麼賠償你？對了，我可以滿足你三個願望。”阿浩竊喜，到，“第一：我想去你那個世界冒險一下。第二：你要送我一隻很厲害的神奇寶貝。這第三嘛，我以後想到了再找你要。”這第三個嘛，當然是用來回家的。

它頭，“這個沒問題，我可以送你一隻實力變態的哈克龍，在那顆‘gs’球裡，第三個以後在告訴我。那我這就把你送過去。”忽然阿浩又想到，應該怎麼開啟這個球，要知道這個球更變態。它又，“你就‘我愛未未，我聖光浩以你的主人之名命令你，甦醒吧’，球就會開了。”阿浩有吐它一身的衝動。這時‘未未’渾身冒起電光，這正是百萬伏特......“你...你又要......我（恨你）......”沒等它完，阿浩便又暈了過去。“我知道你想‘我愛你’。”然後笑了起來，“人類可不要辜負我期望呀”......

“醒醒，醒醒。”又是這句一樣的話。阿浩睜開眼睛，發現他正是大木博士，他欣喜若狂，一下抱住了大木博士。大木博士很驚訝，這個帥氣的孩，竟然抱住了他。這時阿浩一想到未知圖騰的做法，忍不住在心裡咒罵它。“夥子你怎麼在這呀，你的親人呢？”可沒等阿浩完，因為體力透支，又暈過去了。轉身又對茂，“茂，他又暈過去了，我們把他背回去吧。”著茂便把阿浩背回了家......

一天過去了，茂給阿浩喂了食物，阿浩睡了會，便醒了。“你是，茂？對，你就是茂。這是哪呀。”“這是大木博士研究所，也就是我家。你好我是大木茂，你是”阿浩安心了，，“我是聖光浩，你可以叫我阿浩。”茂頭，“你為什麼會在那，你的家在哪？”這時大木博士進來了。“我來自一個很遠的地方，三天前和爸媽一起旅遊，在海上時遇到了風暴，船翻了，我被風刮到了這裡，而爸媽他們......”到這裡，阿浩哽咽了。

大木博士連，“不用難過，我和茂以後就是你的親人。對了你幾歲了。”阿浩這樣做只是讓自己有個身份罷了。“我今年17歲。”“恩，這正好，茂還有三個月就15歲了，到時候，你倆可以一起旅行，好有個照應，我也會放心很多......”

在這三個月裡，阿浩和這祖孫倆培養了深厚的感情，而且阿浩也被整個鎮子的人認識了，大家都很同情他，於是為他建了間兩層樓，阿浩格外感激。在這三個月裡，阿浩也得到了他的初始神奇寶貝，他選了妙蛙種子，因為阿浩覺得妙蛙種子很溫和，阿浩很喜歡。每天阿浩都鍛鍊身體，繼續練他的空手道，他讓花子阿姨為他量身打造了一個套裝，兩套衣服、兩雙手套以及兩雙特殊材質的鞋子（可刀槍不入），當然還有個揹包。還有就是神奇寶貝對戰，訓練家和野生神奇寶貝都有。這樣妙蛙種子學會了很多絕招：能量球、種子機關槍、結草、飛葉風暴、魔法葉以及草系大技陽光烈焰。

而這一切大木博士都看在眼裡，見阿浩這麼努力，又送了阿浩一枚來自神奧的神奇寶貝蛋，粉色帶有一藍色的蛋，並，“還有三天你們就要走了，你還有什麼我可以幫你做的嗎？”阿浩很感動，但也沒有拒絕，“我想瞭解更多的神奇寶貝，所以您能把我的神奇寶貝圖鑑升級為全國的嗎。”大木博士摸摸頭，，“成都、芳緣和神奧地區的倒好辦，只是合眾的要找紅豆杉博士幫忙......對了，我明天正好要把關東地區的初始神奇寶貝傳給紅豆杉博士研究，我和你就親自去一趟，順便把你的圖鑑讓紅豆杉博士升級一下。”

阿浩暗自竊喜，這樣他就可以收服幾隻合眾地區的神奇寶貝。第二天阿浩變和大木博士乘上了去市的飛機。一下飛機阿浩便看到了很多在這幾個月不曾看到的神奇寶貝，阿浩要求走著去紅豆杉博士的研究所，是要收服幾隻神奇寶貝，反正也不遠大木博士便答應了。